Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN10Q96LJ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN10Q96LJ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN10Q96LJ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN10Q96LJ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN10Q96LJ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN10Q96LJ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN10Q96LJ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms