Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPGRIP1Q96KN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPGRIP1Q96KN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms