Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM71F1Q96KD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM71F1Q96KD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms