Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP2Q96HF1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFRP2Q96HF1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms