Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIPA1Q96FS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIPA1Q96FS4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIPA1Q96FS4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms