Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYFIP2Q96F07 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP2Q96F07 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms