Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP36Q96EU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRP36Q96EU6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RRP36Q96EU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms