Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRPL53Q96EL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRPL53Q96EL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL53Q96EL3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms