Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP4Q96DX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP4Q96DX8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms