Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM44Q96DX7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM44Q96DX7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM44Q96DX7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms