Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL29Q96CT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL29Q96CT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL29Q96CT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms