Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPSB1Q96BD6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SPSB1Q96BD6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPSB1Q96BD6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms