Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGMAQ96B86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGMAQ96B86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms