Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX21Q969T3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX21Q969T3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms