Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF34Q969K3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF34Q969K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF34Q969K3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms