Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLP1Q92989 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLP1Q92989 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLP1Q92989 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms