Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB8BQ92930 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB8BQ92930 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB8BQ92930 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms