Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPGAT1Q92604 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LPGAT1Q92604 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPGAT1Q92604 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms