Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN4Q92575 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN4Q92575 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms