Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BAP1Q92560 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BAP1Q92560 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BAP1Q92560 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms