Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM3CQ92520 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM3CQ92520 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM3CQ92520 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms