Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR2Q8WXI2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR2Q8WXI2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms