Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SREK1Q8WXA9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms