Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STAG1Q8WVM7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG1Q8WVM7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG1Q8WVM7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG1Q8WVM7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms