Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCAF4Q8WV16 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DCAF4Q8WV16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms