Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU66

TSPEAR, Thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPEARQ8WU66 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPEARQ8WU66 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPEARQ8WU66 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPEARQ8WU66 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms