Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX54Q8TDD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX54Q8TDD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX54Q8TDD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms