Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM1Q8TC05 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM1Q8TC05 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDM1Q8TC05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms