Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA1Q8NG27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA1Q8NG27 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PJA1Q8NG27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms