Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA6DQ8NFY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6DQ8NFY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms