Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms