Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AVL9Q8NBF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AVL9Q8NBF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AVL9Q8NBF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms