Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM71DQ8N9W8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM71DQ8N9W8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71DQ8N9W8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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