Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBR7Q8N806 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBR7Q8N806 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms