Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC33Q8N5R6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC33Q8N5R6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC33Q8N5R6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms