Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP1Q8N474 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFRP1Q8N474 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFRP1Q8N474 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms