Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHTF2Q8N3S3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHTF2Q8N3S3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms