Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
VPS8Q8N3P4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
VPS8Q8N3P4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS8Q8N3P4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VPS8Q8N3P4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
VPS8Q8N3P4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms