Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1KQ8N3J5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1KQ8N3J5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1KQ8N3J5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms