Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00518Q8N0U6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00518Q8N0U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00518Q8N0U6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms