Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1Q8N0S2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE1Q8N0S2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms