Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC116Q8IYX3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC116Q8IYX3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC116Q8IYX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms