Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOT2Q8IXI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT2Q8IXI1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOT2Q8IXI1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms