Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB43Q86YS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB43Q86YS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms