Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2AQ86YP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2AQ86YP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATAD2AQ86YP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms