Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFR1Q86XK3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFR1Q86XK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFR1Q86XK3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFR1Q86XK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms