Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LDHDQ86WU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDHDQ86WU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDHDQ86WU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LDHDQ86WU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms