Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TCF23Q7RTU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TCF23Q7RTU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms