Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTF1AQ7RTS3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTF1AQ7RTS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTF1AQ7RTS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms