Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRADAQ7RTN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRADAQ7RTN6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms